بدأت جامعة خليفة بعض التغييرات في البرامج الأكاديمية، تماشيًا مع أفضل الممارسات العالمية، وأطلقت خطة جديدة للمنح الدراسية والمزايا لبرامج البكالوريوس والماجستير والدكتوراه، من أجل زيادة التركيز العام على البحوث والابتكار، مع تعزيز عملية إتاحة عروض برامج الدكتوراه للطلبة ذوي الكفاءات العالية.